ورود حجم زیادی از مواد مغذی و رسوبات ناشی ار فرسایش اراضی سطحی به آب می‌تواند باعث مشکلات مانند رشد جلبک‌های سمی، کاهش اکسیژن آب و متعاقب آن نامناسب شدن آب برای مصارف زندگی روزانه و تولیدات صنعتی و کشاورزی ‌شود؛ بنابراین مدیریت منابع آلودگی غیرنقطه‌ای کشاورزی،‌ مدیریت نوع کاربری اراضی، شناسایی منابع آلودگی، کنترل مقدار مواد مغذی و به ویژه مصرف کود شیمیایی و جلوگیری از انتقال آلودگی غیرنقطه‌ای از راه‌های مهم برای کاهش آلودگی آب است.